جريان فتنه دو مبحث اصلي را در دستور كار قرار دادهاست:
1. تمركز بر روي قوا و ايجاد اختلاف بين قواي سهگانه
2. سوق دادن موج سبز اعتراضي به طبقه محروم جامعه
هدف اصلي جريان فتنه از اين اقدامات اين است كه نوعي تنش دائم بر روي روابط سه قوه ايجاد شود، چون با ايجاد تنش بين سه قوه كاركرد آنها مختلف مي شود و قوا درگيري دائم پيدا خواهند كرد و خدمترساني مختل مي شود. در اين زمينه ميرحسين موسوي هم در جايي گفته است كه "اجتماعي شدن جنبش" مستلزم بهمريختگي در حاكميت است. اين جريان همچنين مدعي است كه بحراني شدن روابط بين قوا، رهبر را ناگزير مي كند در امور جزيي هم دخالت نمايد و منجر به اين مي شود كه رهبري روي احمدي نژاد منفعل مي شود و آنها به راحتي با او تسويه حساب مي نمايند.
در موضوع دوم (سوق دادن موج فتنه به سوي طبقات محروم) هم گفته شده است كه با توجه به اجراي طرح هدفمند كردن يارانه ها و مسايل اقتصادي، بهترين راه اين است كه موج دوم يعني طبقه كارگر و كارمند و افراد ضعيف وارد صحنه شوند و به طبقه متوسط كمك كنند. آنها تأكيد كرده اند كه طبقه محروم را به هيچ عنوان نمي شود سياسي كرد، مگر اينكه مشروعيت اقتصادي و پاك دستي نظام و دولت به طور جدي مخدوش شود.
